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Banco não-relacional para armazenamento de dados genéticos (2019)

  • Autores:
  • Autor USP: WEIGERT, RODRIGO DE ANDRADE SANTOS - ICMC
  • Unidade: ICMC
  • Sigla do Departamento: SCC
  • Assuntos: BANCO DE DADOS; MINERAÇÃO DE DADOS
  • Idioma: Português
  • Resumo: Este trabalho explora a utilização de um sistema de banco de dados não-relacional para gerenciar dados oriundos de processos de sequenciamento e genotipagens comerciais, particularmente os chamados SNPs (pronunciado “snips”, do inglês single-nucleotide polymorphisms – polimorfismos de nucleotídeo único). Foi proposta uma solução de armazenamento orientado a documentos capaz de lidar com o grande volume de dados e flexível o bastante para aceitar a importação e exportação de arquivos em diferentes formatos, além de oferecer suporte eficiente a consultas relevantes na área de aplicação. Foi utilizado o MongoDB para um backend no topo do qual foi implementada uma aplicação em Python com interface por linha de comando. Testes foram realizados para avaliação do desempenho do sistema em consultas, exportações e importações, estas avaliadas tanto com relação a tempo quanto a espaço ocupado em comparação com os arquivos originais. Os resultados indicaram que a solução proposta é viável, sobretudo quando versatilidade e poder de consulta forem mais prioritários do que eficiência, a qual sofre algum impacto.
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    Versão Publicadamonografia-rodrigo-final....Direct link
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    • ABNT

      WEIGERT, Rodrigo de Andrade Santos; SOUSA, Elaine Parros Machado de. Banco não-relacional para armazenamento de dados genéticos. [S.l: s.n.], 2019.
    • APA

      Weigert, R. de A. S., & Sousa, E. P. M. de. (2019). Banco não-relacional para armazenamento de dados genéticos. São Carlos.
    • NLM

      Weigert R de AS, Sousa EPM de. Banco não-relacional para armazenamento de dados genéticos. 2019 ;
    • Vancouver

      Weigert R de AS, Sousa EPM de. Banco não-relacional para armazenamento de dados genéticos. 2019 ;

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