Diversidade de cianofagos em lagoas salino-alcalinas do Pantanal (2022)
- Authors:
- USP affiliated author: OLIVEIRA, MARIANA BEATRIZ PEDRITA FERNANDES DE - ESALQ
- School: ESALQ
- Subjects: BACTERIÓFAGOS; BIODIVERSIDADE; BIOINFORMÁTICA; CYANOPHYTA; GENOMAS; LAGOAS; PANTANAL
- Keywords: Cianofagos; Metagenoma; Profagos
- Language: Português
- Abstract: Bacteriófagos (fagos) são vírus que infectam bactérias com o objetivo de assumir o controle do seu metabolismo para produzir proteínas necessárias à sua replicação. Os vírus que infectam especificamente cianobactérias são chamados de cianofagos. Esses fagos são capazes de se manter em estado latente, sem expressar genes, com o seu genoma integrado ao genoma bacteriano. O objetivo deste estudo foi usar a plataforma de bioinformática Phaster para realizar a busca de cianofagos em 4 genomas de cianobactérias [Anabaenopsis elenkinii CCIBt3563, Geminocystis sp. CENA526, Limnospira sp. CENA597, Limnospira sp. CENA650] e em 23 MAGs (Metagenome Assembled Genome) recuperadas a partir do sequenciamento metagenômico das lagoas salino-alcalinas do Pantanal. O grupo de pesquisa do Laboratório de Biologia Celular e Molecular do Centro de Energia Nuclear na Agricultura da Universidade de São Paulo (CENA-USP) coletou amostras de água nestas lagoas nos anos de 2017, 2018 e 2019. As regiões que foram identificadas como pertencentes a fagos foram analisadas para a identificação das prováveis famílias destes cianofagos usando a plataforma de bioinformática NCBI BLASTP. Foram obtidos resultados para as famílias Myoviridae, Siphoviridae e Podoviridae, o que indica que as cianobactérias dessas lagoas salino-alcalinas podem estar sendo infectadas por cianofagos. Identificar a presença de cianofagos é importante, pois estes organismos podem ser utilizados para realizar o controle biológico de florações de cianobactérias. Quando não são controladas, essas florações podem prejudicar a qualidade de sistemas aquáticos provocando danos ambientais, econômicos e de saúde pública
- Imprenta:
- Place of publication: Piracicaba
- Date published: 2022
-
ABNT
OLIVEIRA, Mariana Beatriz Pedrita Fernandes de. Diversidade de cianofagos em lagoas salino-alcalinas do Pantanal. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação) – Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2022. Disponível em: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/8f77be20-24e6-4ccd-bdb6-91e79be1120d/TCCMarianaBPFdeOliveira.pdf. Acesso em: 28 abr. 2024. -
APA
Oliveira, M. B. P. F. de. (2022). Diversidade de cianofagos em lagoas salino-alcalinas do Pantanal (Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/8f77be20-24e6-4ccd-bdb6-91e79be1120d/TCCMarianaBPFdeOliveira.pdf -
NLM
Oliveira MBPF de. Diversidade de cianofagos em lagoas salino-alcalinas do Pantanal [Internet]. 2022 ;[citado 2024 abr. 28 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/8f77be20-24e6-4ccd-bdb6-91e79be1120d/TCCMarianaBPFdeOliveira.pdf -
Vancouver
Oliveira MBPF de. Diversidade de cianofagos em lagoas salino-alcalinas do Pantanal [Internet]. 2022 ;[citado 2024 abr. 28 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/8f77be20-24e6-4ccd-bdb6-91e79be1120d/TCCMarianaBPFdeOliveira.pdf
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